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廣州賽誠生物科技有限公司
廣州市天河區黃埔大道中124號2705室
電話:020-29031124
手機:18102256923
Email:servers@gzscbio.com
Fax:020-85625352
QQ:2913120624
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RNA pull- down實驗常見問題
問題1:RNA 降解
可能原因:1)無核酸酶的環境被破壞
2)體外轉錄的RNA探針降解
解決辦法:1)清洗和使用新開的離心管和試劑等
2)RNA探針合成后,電泳檢測其長度和濃度
問題2:RNA結合蛋白的親和力不夠:
可能原因:1)結合緩沖環境沒有優化
2)裂解不完全
3)磁珠用量不足
4)RNA探針用量不足
解決辦法:1)優化孵育時間、溫度 、鹽濃度等條件
2)增加裂解液和蛋白上樣量的比例
3)增加裂解液
4)增加磁珠用量
5)增加探針用量
6)確定生物素和鏈霉親和素效率
問題3:RNA結合蛋白沒有結合
可能原因:1)靶蛋白量不足
2)緩沖體系不對
3)RNA探針和蛋白的親和力本來就低
解決辦法:1)增加上樣蛋白量
2)應用低鹽體系
3)加入交聯試劑
問題4:結合的非特異性高
可能原因:1)緩沖環境沒有優化
2)緩沖環境嚴謹性低
3)樣品沒有裂解完全和裂解體系沒有優化
解決方法:1)優化孵育時間溫度 鹽濃度等條件
2)使用嚴謹性高的緩沖體系
3)調低RNA探針和樣品的比例
4)提高裂解液的量
問題5:WB信噪比高
可能原因:1)陽性信號率低
2)一抗效率低
3)蛋白沒有充分溶解
解決方法:1)增加二抗的量
2)用敏感度的化學發光液
3)用細胞裂解液預孵一抗
4)增加樣品的量
5)確定有沒有其他可能的結合情況
6)增加裂解液用量
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